Im Jahr 1938 wurde die Kinderklinik in die Verwaltung des Gaukrankenhauses eingegliedert. Als Abteilung des Gaukrankenhauses wurde das Kinderspital Teil der „NS-Organisation“ für Krankenmorde in der Steiermark. Kinder wurden u. a. auf ihren „Wert“ begutachtet, für medizinische Zwecke missbraucht, für Forschungen in andere Abteilungen überwiesen oder aufgrund bewusster Vernachlässigung, Unterlassung von medizinischer Behandlung oder Medikamentenverabreichung ein vorzeitiges „Gestorben werden“ eingeleitet.